Der WWTF führt Ausschreibungen im Rahmen von thematischen Schwerpunkten durch. Die Schwerpunkte werden längerfristig eingerichtet, damit darin am Wiener Wissenschaftstandort international wettbewerbsfähige wissenschaftliche Kompetenzen auf- und ausgebaut werden können. Der Einrichtung von Schwerpunkten geht ein umfassender Recherche- und Konsultationsprozess voraus.
Thematische Ausschreibungen laden die entsprechende Wiener Forschungscommunity ein, größere Forschungsprojekte, Forschungsgruppen oder kleinere Formate (z.B. Summer Schools) einzureichen.